Родился 9 декабря 1878 года в семье священника села Брейтова Мологского уезда Ярославской губернии Алексея Стефановича Надеждина. Мать - Александра Арсеньевна, дочь священника села Захарьина Мологского уезда Арсения Архиповича. В 1881 году окончил Ярославскую духовную семинарию и поступил в Санкт-Петербургскую духовную академию. На третьем курсе обучения в академии, 4 (16) апреля 1884 года, пострижен в монашество с именем Никанор. 24 марта (5 апреля) 1885 года рукоположен во иеромонаха. В этом же году окончил Академию со степенью кандидата богословия (выпускная работа посвящена библиотеке Константинопольского патриарха Фотия) и назначен преподавателем Литовской духовной семинарии. В 1888 году назначен инспектором Тифлисской семинарии. С 1891 года — ректор Томской семинарии в сане архимандрита. Проявил себя как деятельный организатор, пастырь и проповедник. Указом Священного Синода от 27 октября (8 ноября) 1897 года архимандрит Никанор был назначен епископом Киренским, викарием Иркутской епархии. Хиротонисан 7 декабря в Вознесенском монастыре в Иркутске. С 27 сентября (9 октября) 1898 года — епископ Якутский и Вилюйский. С 17 (30) января 1905 года — епископ Пермский и Соликамский. С 28 ноября (11 декабря) 1908 года — епископ Олонецкий и Петрозаводский. При нем в епархии в 1911 году открылось Каргопольское викариатство. Был председателем особой комиссии при Св. Синоде для выработки правил перевозки св. икон по водным путям. Кавалер орденов Св. Анны I и II степеней, Св. Владимира III степени, медали в память Александра III. Скончался 19 ноября 1916 году в Петрозаводске после тяжелой болезни, похоронен в ограде Святодуховского кафедрального собора за алтарём.
Источники:
1. Наставления Архиепископа воспитанникам Якутской духовной семинарии. (Из поучений 1900-1902 гг.). Якутск, 1903.
2. Преосвященнейший Никанор, епископ Олонецкий и Петрозаводский; его назначение, прибытие и начало служения в г. Петрозаводске // Олонецкие епархиальные ведомости. 1909. № 3. С. 63—73.
3. Двадцатипятилетие служения Церкви Божией и Отечеству Преосвященнейшего Никанора, Епископа Олонецкого и Петрозаводского // Олонецкие епархиальные ведомости. 1910. № 23. С. 505—507.
4. Суперанский Н. Светлой памяти преосвященного Никанора, епископа Олонецкого и Петрозаводского // Олонецкие епархиальные ведомости. 1916. № 32. С. 623—625; № 33. С. 633—641; № 34. С. 653—670.
5. Крупкин А. Венок на могилу преосвященного Никанора // Олонецкие епархиальные ведомости. 1916. № 33. С. 642—643.
6. Островский Д. В. Преосвященный Никанор, Епископ Олонецкий и Петрозаводский [Некролог] // Известия Общества изучения Олонецкой губернии. 1916. № 5-6. С. 52—60.