В 1876 году был открыт в Рыбинске мореходный класс. В нем готовили штурманов дальнего плавания, шкиперов и штурманов каботажного плавания. В 1899 г. преобразован в речное училище. М.В. Черепанов стал первым начальником училища. Сын архангельского купца, шкипер дальнего плавания, заведовал Таганрогским мореходным классом, с апреля 1897 г. преподаватель специальных наук в Рыбинском мореходном классе, с 3 февраля назначен заведующим. Училище размещалось в деревянном 2-х этажном доме на улице Пушкинской, арендованном у приюта им. Баскаковой и Тюменева (не сохранился). Общежития не было, жили на частных квартирах. В Первую мировую войну в Рыбинск было эвакуировано Петроградское речное училище. В 1918 г. оно размещалось в имении Морозовой в селе Петровском, бывшем имении Михалковых. В 1919 г. оно временно сливается с Рыбинским речным училищем. Начальниками училища после Черепанова были: Богданов Дмитрий Александрович, Васильев Александр Александрович, Новиков Николай Иванович.
В сентябре 1919 г. речное училище преобразовано в техникум водного транспорта с 3 отделениями: судомеханическим, судоводительским и судостроительным, затем открывается гидромеханическое и электротехническое. Техникум размещается на Волжской Набережной, д. 21. Это было имение рыбинского купца Рябинина. Заведующий техникума - Р.М. Брувель. Техникум существовал до 1923 г. В октябре 1923 г. он реорганизуется в школу 2 ступени водного транспорта с 10 -летним сроком обучения, которая размещалась на пр. Ленина, д. 49., а 2 последних курса обучались в доме № 24 по ул. Урицкого (ныне больница Водников), занимали 2-ой этаж, а на 1 находилась амбулатория водного транспорта. Начальником техникума был Гершкович Исаак Исаевич. В 1925-1930 гг. существовала только школа водного транспорта. В августе 1930 г. вновь открылся техникум с судомеханическим и судостроительным отделениями. С 1 марта 1932 г. при техникуме открыт "рабфак", обучение без отрыва от производства, вечером. В 1934г. открылось технологическое отделение, в этом же году осенью в Рыбинский техникум влился Череповецкий техникум водного транспорта. В августе 1934 г. техникум получил новое здание за р. Черемухой, построенное на месте Петровской ярмарки. В 1932-1936 гг. в техникуме учился Ю.В. Андропов - комсорг техникума. В 1934 г. сделан первый выпуск специалистов водного транспорта. В августе 1956 г. на основе приказа министра речного флота от 18 августа 1956 г. техникум был реорганизован в речное училище. В 1956-1957 гг. переводится Рижское речное училище и объединяется со Щербаковским (Рыбинским) училищем в одно учебное заведение с наименованием "Щербаковское речное училище им. В.И. Калашникова". Училище готовит техников по специальностям: электрооборудование судов и судовые силовые установки. В 1976 г. в связи со 100-летием училища и за успехи в подготовке специалистов водного транспорта Указом Президиума Верховного Совета СССР от 2 декабря 1976 г. училище награждено орденом "Знак Почета". В 1984 г. открыт музей училища. Училище является одним из основных и крупнейших учебных заведений федеральной службы речного флота России.